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프로테옴 분석을 처음 진행하시는 경우

Mammalia fluid, cell 등에서의 단백질의 발현 변화를 관찰하시고자 한다면
[2DE > image analysis > MS 분석] 과정을 추천해 드립니다.

  • 1) 2DE: 샘플 간의 단백질 발현 차이를 spot 형태로 확인 가능 합니다.
  • 2) Image analysis: 각 spot을 분석하여 발현 수준을 수치화하며, 샘플별 고유의 spot도 확인할 수 있습니다.
  • 3) MS 분석: 특정 spot에 대한 Protein Identification을 진행합니다(MALDI-TOF 또는 LC-MS 기법 활용).
  • 4) 위 과정을 통해 예측된 단백질에 대해 추가적인 프로테옴 분석(예: western blot 등)을 통해 검증 과정을 수행합니다.

2DE 분석보다 정확도가 높은 고수준의 분석이 필요하신 경우

DIGE 분석을 추천 드립니다.

  • 1) DIGE: 샘플 간의 단백질 발현 차이를 spot 형태로 확인할 수 있습니다.

    각 샘플에 대해 internal standard를 첨가하고 기본 1회 분석 set에서 비교 및 대조군을 하니의 pair로 구성하여 3회 반복 실험을 수행하므로 spot의 미세한 차이를 정확하게 감별할 수 있습니다.

  • 2) Image analysis: 반복 실험 결과를 분석하여 p-value 0.05 미만의 유의수준을 충족하는 spot을 선별하게 됩니다.
  • 3) MS 분석: 유의적인 차이를 보이는 spot에 대해 Protein Identification을 수행합니다(MALDI-TOF 또는 LC-MS 방법).
  • 4) 위 과정을 통해 예측된 단백질에 대해 추가적인 프로테옴 분석(예: western blot 등)을 통해 검증 과정을 수행합니다.

프로테오믹스 기법을 통해 대상 단백질을 선정하신 후 Validation 방법

  • 1) Western blot, Immunohistochemistry 또는 ELISA kit를 이용하여 특정 단백질의 발현 변화를 확인할 수 있습니다.
  • 2) Biomarker 발굴 및 검증이 목적일 경우에는 분석 샘플의 갯수를 늘려서 결과의 신뢰도를 높이는 것을 권장 드립니다.