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3. Nano LC ESI ion trap tandem MS 서비스 절차 및 수가
- 시료준비
- 1D SDS-Page band 및 2D-Spot 상태의 단백질
In-gel digestion 의뢰 시
- Band 및 gel을 25~50 mM NH4HCO3 에 충분히 담아 오세요.
- LC-MS/MS 담당자가 in-gel digestion을 하게 됩니다. (1일소요)
- In-gel digestion 된 peptide
-10ul 이하의 25~50 mM NH4HCO3 에 담아오세요.
- Solution 상태의 protein
Solution 상태로 냉장 보관하여 가져오세요.
Sample 상태에 따라 in-solution 혹은 in-gel solution으로 digestion하게 됩니다.
- 단백질의 수에 따라 LC-MS/MS running time이 달라집니다.
- 1~5개 사이 약 40~80 min, 5~10 사이 약 80~120 min 10개 이상 120 min 이상
- 의뢰자와 상의 후 결정
- 데이터는 MS/MS 결과에 의해 얻어진 peptide로 검색된 protein의 List, sequence, 분자량, pI값, species,
peptide match 수, score등으로 보여집니다. 각각의 내역을 excel 파일로 보내드립니다.
- 주의 사항
다음과 같은 경우 좋은 MS데이터를 얻기가 어렵습니다.
- 다량의 salt가 포함된 protein/peptide(전 처리시 주의요망)
- 충분한 digestion이 되지 않은 protein ( 1/20~1/50 비율로 첨가 요망)
- sample에 particle(먼지 및 기타 이물질)이 포함되어 있을 경우(시스템 자체에 손상)
- 시료당 분석 가격은 19만원 입니다. 서비스 신청을 하시기 전, 반드시 연구원 (이은영 :02-2123-6625,
![](http://211.32.65.139/email.php?e=HKnlK5RiT%2FCQVF2lf9%2FBWt6XrBu0EI4FqROZ4fVwO3QV0hbF1v97lahtgibSdHA%2B") )과 해당 서비스에 대해서 꼭 문의하신 후, 서비스 신청을 하시기 바랍니다.
- 샘플 보내실 주소 : 서울 서대문구 신촌동 연세대학교 산학협동관 421호.
- 분석 서비스 요금은 연세대학교 계좌로 입금시켜 주시면 됩니다. 연세대학교 명의의 계산서가 발부되며, 세금계산서는 발급이 안되고, 카드 결재도 안됩니다. 결재계좌안내는 메일로 드립니다.
- 분석서비스 소요시간
| Nano-LC-MS/MS 5 working day (1~5 sample) |
| destaining |
2 시간 (per 10 spots) |
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| In-gel digestion |
12 시간 |
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| Poros desalting, spotting |
2 시간 |
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| LC-MS |
7시간 |
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| Database searching |
3 시간 |
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FFE 
2008 © Yonsei Proteome Research Center